Attention ; ce qui suit dévoile des éléments importants de l'intrigue.
Rassemblés chez les Vacker, Sophie, Keefe, Fitz, Dex et Biana s'apprêtent à s'enfuir et à rejoindre le Cygne Noir. Pour mener à bien leur départ, Alden retire tous leurs accessoires permettant au Conseil de pouvoir les suivre. Une fois les pendentifs d'identification et les nexus enlevés, ils sont prêts à partir et quitter les Cités perdues, mais juste avant de partir, ils sont retardés par la Conseillère Oralie venue donner à Sophie la cache du Conseiller Kenric. Une fois leurs adieux faits, ils se téléportent à Florence. Là-bas, ils mangent des gelato (crèmes glacées) et essayent de se repérer à l'aide des indices laissés. Plus tard, ils arrivent à la planque du Cygne Noir avec l'aide de M. Forkle>après un long périple. Sur le chemin, ils découvrent que Della, la mère de Fitz et Biana fait partie du voyage. En effet, à l'aide de son talent d'Éclipseuse, elle a pu les suivre.
À Alluveterre, ils commence par visiter l'endroit où ils vivront pendant leur séjour et sont emmenés dans la salle commune du Cygne Noir. Après une discussion, Sophie réussit à obtenir un de ses souvenirs effacés, celui du garçon disparu. Elle le récupère avec l'aide de Fitz car ils se révèlent être des Télépathes possédant une connexion spéciale, autrement dit des Apparentés. Après que le souvenir soit découvert comme étant sans intérêt, la jeune fille retourne dans sa cabane perchée dans les arbres et rencontre Calla, une gnomide qui a participé au Projet Colibri. Durant cette journée, ils découvrent qu'une épidémie décime les gnomes et que les ogres et les Invisibles en sont sûrement les responsables.
Le jour suivant, Sophie et Fitz s'entraînent en tant qu'Apparentés, avec Granite, un membre du Comité. Sophie essaie d'apprendre à Fitz comment communiquer avec Silveny, ce qui s'avère être un succès.
Le lendemain matin, elle est réveillée par Dex qui lui révèle avoir trouvé un moyen de pirater les archives du Conseil pour identifier le garçon disparu. M. Forkle apprend la nouvelle et, accompagné du reste du Comité, il leur fait promettre de ne pas poursuivre les recherches, en donnant à Dex un moyen de les aider et d'améliorer ses compétences en Technopathie.
Le lendemain, les cinq amis s'entraînent lorsque Sophie révèle presque à Fitz qu'elle l'aime, cependant, elle est interrompue par Keefe et ne le dit pas à Fitz. Après cela, Calla intervient et explique que deux gnomes qui surveillent les Territoires neutres ont repéré des membres des Invisibles. Les gnomes expliquent qu'ils ont vu Lady Gisela blessée et sûrement morte et, Sophie et Fitz regardent dans leurs souvenirs pour le confirmer. Keefe est dévasté quand on lui dit qu'ils ne peuvent pas aller au près de sa mère. Il ne veut pas l'admettre mais il est démoralisé.
Pendant un jour ou deux, Keefe est furieux et triste et ne fait aucune apparition. Sophie le réconforte et pour lui redonner du moral, organise une "soirée pyjama". Le lendemain matin, Calla la réveille et l'emmène avec Biana dans les Territoires neutres afin d'enquêter sur l'épidémie qui décime les gnomes. Elles sont attaquées par un membre Psionipathe des Invisibles mais Biana les sauve. Quelques jours plus tard, Calla annonce que la seule façon de trouver un antidote est d'utiliser les fleurs de panacier.
M. Forkle emmène Sophie et Keefe rendre visite à Gethen, un membre des Invisibles qu'ils ont capturé. M. Forkle lui révèle des informations tandis que Gethen se moque de Keefe. Quand les trois elfes reviennent à Alluveterre, Keefe est maintenant extrêmement frustré et demande des perlucides, des perles qui vont l'aider à accéder à ses souvenirs d'enfance pour trouver des indices. Son souhait est accordé et il part en direction de sa cabane pour chercher et obtenir des réponses.
Pendant ce temps, Dex fabrique un appareil, trouve un parchemin et découvre un secret sur les drakostomes, ce qui pourrait impliquer que le Conseil était au courant de l'épidémie qui ravage le peuple gnome.
Finalement, les cinq amis se rendent à Exil afin de sauver Prentice. Au cours de ce sauvetage, ils sont coincés par le Conseil et Fitz est attaqué par un arthropleura et est gravement blessé. Alors, Sophie menace de livrer la cache de Kenric à d'autres espèces, ce qui pourrait déstabiliser le monde entier. Après de longues négociations, le Conseil accepte de laisser partir le Cygne Noir et d'échanger Prentice contre Gethen si les cinq jeunes elfes sont bannis à Exillium.
Alors que Fitz est encore alité, M. Forkle révèle à Sophie que Sir Astin fait partie de ses multiples identités. Quand ils ont finalement la chance de vérifier l'état de Prentice, son esprit est vide et Sophie déclare que "Prentice a disparu" et qu'il n'est certainement plus brisé.
Quelques jours plus tard, Edaline vient rendre visite au Cygne Noir et dépose Iggy, que Biana propose de prendre en charge. Elle aide Sophie à faire disparaitre la cache dans le néant auquel elle ne peut accéder qu'en prononçant oralement un mot de passe : 221B Baker Street.
Alors que Fitz continue de guérir lentement, Sophie aide Keefe à garder ses souvenirs, car il devient un peu fou, encombré de souvenirs. Calla quitte Alluveterre. Pendant ce temps, Sophie aide Granite, M. Forkle et Wylie qui essayent de tirer des informations de l'esprit de Prentice. Plus tard, Fitz guérit totalement.
Lorsque les cinq amis se préparent à aller à Exillium, Sophie découvre qu'elle a quatorze ans selon les comptes des elfes. À Exillium, ils suivent un entraînement rigoureux et rencontrent des jumeaux de leur âge, Linh et Tam Song. Keefe et ce dernier ne s'entendent pas du tout. Durant leur séjour à Exillium, Sophie contribue à rendre celui-ci beaucoup plus amical et reçoit également un message de Silveny disant qu'elle attend un poulain. Plus tard, M. Forkle rencontre Linh, Hydrokinésiste et Tam, Ténébreux. Sophie parle à Oralie et à Terik à propos de ce que M. Forkle découvre avec Tam - que la peste se nourrit de sombrume. Sophie et Fitz continuent à s'entraîner en tant qu'Apparentés avec M. Forkle, cette fois en faisant des exercices émotionnels avec l'aide de Keefe. Ils parviennent à dépasser le blocage télépathique de M. Forkle et comprennent qu'il a l'intention de demander à Lord Cassius de rejoindre le Cygne Noir, ce qui rend Keefe furieux. Calla découvre que le Conseil était au courant de l'épidémie et est dévastée. Les cinq se déguisent et retournent dans les Cités perdues, où ils découvrent que Fintan est toujours vivant, et ont la preuve que les ogres et les Invisibles sont les responsables de l'épidémie depuis le début. Le roi ogre, Dimitar, propose de leur donner le remède si les gnomes des Cités perdues acceptent de devenir les esclaves des ogres. Après ça, Sophie et ses amis travaillent avec Alvar afin de se rendre à Ravagog pour voler le remède de l'épidémie gardé par le roi Dimitar, mais lorsqu'ils arrivent, ils découvrent que c'était un faux. Avec l'aide de Linh, ils s'échappent tous en inondant la cité ogre. Il est révélé qu'Alvar est membre des Invisibles depuis le début. Le bannissement des sept adolescents est levé et on leur accorde une réintégration de leurs familles et à Foxfire. Quand ils se réunissent, et communiquent les nouvelles à la famille Vacker, Calla annonce des nouvelles dévastatrices. Pour créer les fleurs de panacier, elle devra se transformer en l'arbre elle-même. Une fois que Calla s'est transformée, quelque chose semble avoir disparue avec Keefe. Pendant que lui et Sophie parlent, elle demande où il va, et il donne une réponse générique. Mais quand il sort un cristal de saut jaune, Sophie l'attrape en sautant, et elle est emmenée à une réunion où il est révélé que Keefe va rejoindre les Invisibles. La suppliant pour qu'elle l'écoute et s'en aille, Keefe utilise la voix de Sophie pour livrer la cache aux Invisibles et aide Sophie à s'échapper. Elle revient et annonce à M. Forkle et à Granite les nouvelles, puis ils révèlent être respectivement le Magnat Leto et Sir Tiergan.
Le livre se termine avec le Magnat Leto qui dit : "Prentice s'est réveillé ce matin".
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